二本院校，成绩优异，四六级已过，有没有机会申请斯坦福大学商学院？

还是有机会的。美国大学的研究生院对于国内本科没有要求和限制，只要教育部承认的本科学历即可，申请名校商学院要看本科成绩，工作经验，所工作的公司和任职的职位，还要看你写的材料，还要考察你的托福和gmat成绩，所以要综合来看，如果个方面条件优秀，完全有可能申请到好学校。