我现在是F1学生，没有使用CPT在一家公司做行政助理，已经做了近两个月（3月至5月），马上要离职了，公司说要给我这段时间的工作pay，一共近2块钱，我可以等到1月opt 申请下来之后 再拿公司的paycheck吗？

由于您现在没有cpt，所以其实是没有工作许可的，不建议您收取公司payroll下的paycheck。您可以和公司协商在您opt生效后再商讨您的薪水问题。实际操作上也是可以的。因为您在opt期间是可以带薪工作的，但现阶段您没有cpt是不可以的。您可以和您公司沟通好，让您的payroll period也是在您opt生效之后。